La principale source de contamination des animaux élevés sur un sol pollué par la chlordécone est avant tout la terre qu’ils ingèrent. La chlordécone peut aussi se retrouver dans les parties basse de certains végétaux que pâturent les animaux et dans certains fourrages, la bagasse et l’eau d’abreuvement.

Afin de protéger la population, un dispositif de contrôle a été mis en place dans les abattoirs de Guadeloupe pour mesurer la teneur en chlordécone des animaux provenant d’élevages identifiés à risque. Les analyses pratiquées permettent d’éloigner les carcasses non conformes. Un dispositif également valable pour les oeufs.